霍邱县人民检察院现有内设机构8个，如下：

业务机构有：第一检察部（普通刑事犯罪检察）、第二检察部（重大与职务经济犯罪检察）、第三检察部（刑事执行检察）、第四检察部（民事行政与公益诉讼检察）、第五检察部（控告申诉检察，加挂国家赔偿工作办公室牌子）、综合业务部（综合业务，加挂法警大队牌子）。

行政管理机构有：办公室、政治部。

机关党组织办事机构设置按照有关规定执行。

驻所检察室不纳入改革范围，待中央出台新的规定再行规范。